Do nesreče je prišlo, ko je 25-letni voznik iz Ljubljane vozil osebni avtomobil po Podpeški cesti, iz smeri Brezovice proti Podpeči ter ustavil vozilo pred prehodom čez železniško progo, kjer so izmenično utripajoče luči na semaforju in spuščeni polzapornici naznanjali, da se prehodu približuje vlak.

V trčenju sta v osebnem avtomobilu umrla voznik in 21-letna sopotnica iz okolice Ljubljane.

Med čakanjem na prosto pot, je iz njegove desne pripeljal potniški vlak, ki je vozil v smeri Borovnice. Potem, ko je vlak zapustil nivojski prehod čez železniško progo, je voznik zapeljal na železniški prehod in pri tem obvozil spuščeno polzapornico. V tistem trenutku je iz smeri Borovnice oziroma njegove leve stani pripeljal še potniški vlak, ki je trčil v osebni avtomobil in ga potiskal pred seboj.